Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms