Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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PtprfA2A8L5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PtprfA2A8L5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PtprfA2A8L5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PtprfA2A8L5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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PtprfA2A8L5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtprfA2A8L5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtprfA2A8L5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtprfA2A8L5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtprfA2A8L5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtprfA2A8L5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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