Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms