Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrit3W8DXL4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrit3W8DXL4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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