Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms