Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm3550W4VSN7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms