Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afb2S4R1M3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms