Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Krt27Q9Z320 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Krt27Q9Z320 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms