Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms