Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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