Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms