Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn7Q9Z261 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn7Q9Z261 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms