Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms