Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms