Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf394Q9Z1D9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms