Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne6Q9Z140 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms