Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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