Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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