Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin2Q9WVE8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms