Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms