Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms