Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms