Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trex2Q9R1A9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trex2Q9R1A9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms