Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Clec4eQ9R0Q8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Clec4eQ9R0Q8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Clec4eQ9R0Q8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Clec4eQ9R0Q8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Clec4eQ9R0Q8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Clec4eQ9R0Q8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Clec4eQ9R0Q8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Clec4eQ9R0Q8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Clec4eQ9R0Q8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms