Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L9

Cd164, Sialomucin core protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164Q9R0L9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms