Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms