Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms