Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms