Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sh2d3cQ9QZS8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sh2d3cQ9QZS8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh2d3cQ9QZS8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh2d3cQ9QZS8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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