Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphs1Q9QZS7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphs1Q9QZS7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms