Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms