Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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