Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt3Q9QZ47 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms