Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoaQ9QUI0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms