Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms