Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdc42ep4Q9JM96 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms