Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rfx5Q9JL61 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rfx5Q9JL61 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rfx5Q9JL61 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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