Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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