Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chrac1Q9JKP8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chrac1Q9JKP8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chrac1Q9JKP8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chrac1Q9JKP8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chrac1Q9JKP8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chrac1Q9JKP8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chrac1Q9JKP8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chrac1Q9JKP8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Chrac1Q9JKP8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Chrac1Q9JKP8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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