Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Tmod2Q9JKK7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Tmod2Q9JKK7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Tmod2Q9JKK7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Tmod2Q9JKK7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Tmod2Q9JKK7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Tmod2Q9JKK7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Tmod2Q9JKK7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Tmod2Q9JKK7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Tmod2Q9JKK7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Tmod2Q9JKK7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Tmod2Q9JKK7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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