Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.8 ms