Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms