Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK23

Psmg1, Proteasome assembly chaperone 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg1Q9JK23 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmg1Q9JK23 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmg1Q9JK23 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms