Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms