Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LratQ9JI60 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms