Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms