Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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