Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn19Q9ET38 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms