Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms