Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rb1cc1Q9ESK9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
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Rb1cc1Q9ESK9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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Rb1cc1Q9ESK9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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Rb1cc1Q9ESK9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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Rb1cc1Q9ESK9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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Rb1cc1Q9ESK9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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Rb1cc1Q9ESK9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
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